1. Căn cứ vào nhiệm vụ của trung tâm, tham mưu cho Giám đốc hướng dẫn các khoa, phòng lập kế hoạch để thực hiện các mặt hoạt động của Trung tâm Y tế từ y tế dự phòng đến hoạt động chuyên môn khác; đánh giá, hiệu quả việc thực hiện kế hoạch, quy chế Trung tâm Y tế để báo cáo Giám đốc xem xét, chỉ đạo;

2. Tổ chức đào tạo liên tục cho các thành viên trong toàn Trung tâm Y tế; phối hợp với các trường đào tạo để tổ chức thực hành cho học viên;

3. Tổng kết đánh giá công tác chuyên môn từ công tác y tế dự phòng đến công tác điều trị; triển khai công tác nghiên cứu khoa học trong toàn đơn vị;

4. Tổ chức việc điều hòa phối hợp công tác giữa các khoa, phòng, trạm Y tế  trong đơn vị; giữa đơn vị với các cơ quan có liên quan nhằm nâng cao hiệu quả công tác khám bệnh, chữa bệnh của Trung tâm Y tế;

5. Thực hiện tốt công tác chỉ đạo tuyến để chỉ đạo và hỗ trợ chuyên môn kỹ thuật cho tuyến dưới;

6. Tổ chức thực hiện công tác hợp tác quốc tế (nếu có) theo kế hoạch của đơn vị và quy định của Nhà nước;

7. Bảo đảm việc lưu trữ, thống kê, khai thác hồ sơ bệnh án theo quy định;

8. Xây dựng quy hoạch phát triển chuyên môn kỹ thuật của đơn vị để trình Giám đốc xét duyệt và báo cáo cấp trên;

9. Định kỳ sơ kết, tổng kết công tác y tế, báo cáo Giám đốc và cơ quan cấp trên;

10. Chuẩn bị các phương án phòng chống cháy nổ, thiên tai, thảm hoạ và các trường hợp bất thường khác để trình Giám đốc và tổ chức thực hiện;

11. Kiểm tra công tác bảo hộ lao động, đặc biệt đối với các máy tối nguy hiểm theo danh mục quy định của Nhà nước;

12. Tổ chức học tập cho các thành viên trong đơn vị hoặc các đơn vị, bộ phận tuyến dưới học tập về bảo quản, sử dụng, sửa chữa thiết bị y tế nhằm nâng cao tay nghề và sử dụng thiết bị y tế có hiệu quả;

13. Triển khai truyền thông giáo dục sức khỏe bằng nhiều hình thức như: Truyền thông trên loa đài của đơn vị, tờ rơi, băng rôn, áp phích, xe…;

14. Kiểm tra và báo cáo hoạt động công tác truyền thông giáo dục sức khỏe;

15. Tham mưu cho Hội đồng khám tuyển Nghĩa vụ quân sự: Thành lập Đoàn khám và tổ chức khám, báo cáo kết quả cho các cơ quan liên quan;

16. Tham mưu cho Giám đốc Trung tâm Y tế thành lập Tổ kiểm soát nhiễm khuẩn: Xây dựng kế hoạch kiểm soát nhiễm khuẩn định kỳ và hàng năm trình Giám đốc phê duyệt và tổ chức thực hiện; là đầu mối phối hợp với các khoa, phòng liên quan giám sát công tác kiểm soát nhiễm khuẩn.